山上の上醍醐と西麓の平地伽藍に分かれている。上醍醐は貞観16年（874）から、平地伽藍（がらん）は延喜４年（904）から整備され、延喜７年（907）に勅願寺となる。山上伽藍の薬師堂、清龍宮拝殿、平地伽藍の五重塔、金堂、三宝院の殿堂表書院、唐門の６つは国宝建造物、特別名勝である三宝院寺庭園の他、９棟１基の建造物が重要文化財に指定されている。

　特に、天歴５年（951）に落成、完成された平地伽藍の五重の塔は京都における現存最古の建造物で、初層内部に描かれた両界マンダラ壁画は密教寺院の特性を示している。

　応仁の乱により五重塔をのぞいてほとんどの堂宇が焼失。慶長４年（1598）、豊臣秀吉が花見を催して再興、徳川家からも寄進を得るなどして、現在の伽藍のほとんどが整えられた。

◆豊臣秀吉と醍醐の花見

　慶長３年（1598）３月15日、豊臣秀吉は淀君の産んだ長子、満４歳半の秀頼を連れ、正室や側室とともに醍醐寺で盛大な花見の宴を催した。秀吉62歳、５カ月後に波乱の生涯を閉じた。尾張出身、初名木下藤吉郎。織田信長につかえ本能寺の変ののち、明智光秀を滅ぼし天下を統一。関白太政大臣、のち関白を養子秀次に譲り太閤を名乗る。文録・慶長の役を起こし朝鮮に出兵。戦い半ばに病没（1593-1615）。辞世「露とおち 露と消えにし 我が身かな なにわのことも 夢のまた夢」。

　京都東山を東に越えると山科。この山科盆地と琵琶湖を隔てているのが醍醐山を中心とする山並み。山上の上醍醐と山下の下醍醐に分かれ。山頂までは小１時間の険しい山道。

　山上の泉水が美味。開山理源大師が堂宇を建てた時、白髪の翁が泉の清水を汲み、大師が口に含んで「ああ醍醐味なるかな」といったところから「醍醐寺」と名付けられた。

　北へ徒歩15分、小野小町ゆかりのお寺でシャクナゲが美しい随心院、さらに西へ行くとスイレンが見事な平安様式大庭園の勧修寺がある。南に行くと親鸞ゆかりの日野法界寺で東西本願寺の誕生院がある。