860(貞観2)年に清和天皇の勅願により創始された。浄土宗には、総本山である知恩院(東山区)のほかに七つの大本山があり、清浄華院は金戒光明寺(左京区)、知恩寺(同)、増上寺(東京都港区)、善導寺(福岡県久留米市)、光明寺(神奈川県鎌倉市)、善光寺大本願(長野市)とともに、その一つに数えられる。